干货|一文帮你轻松解读免疫沉淀与免疫共沉淀的差异
好多同学反馈对免疫沉淀与免疫共沉淀无法区分,选试剂找不到正规的平台,实验操作技巧没有掌握,实验无法正常安排,操作时长增加,耽误了实验进度。今天小编就为大家解读一下免疫沉淀与免疫共沉淀的区别和运用,让你的科研之路不再EMO。
“免疫沉淀”一般是指采用固定在固相支持物上的结合蛋白,进行小规模的蛋白质亲和纯化的实验。将蛋白通过微珠(纯化介质)进行富集。免疫沉淀根据检测的目的可以分为免疫沉淀、免疫共沉淀(Co-IP)、染色质免疫沉淀(ChIP)和RNA免疫沉淀(RIP)。
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免疫共沉淀分析(Co-IP)是免疫沉淀的延伸,基本的技术都是采用目标抗原特异性的固相化抗体;但IP的目标是纯化单一抗原,而Co-IP旨在分离抗原及与抗原结合的蛋白质或配体,主要用于蛋白-蛋白相互作用检测。如果样品溶液中存在与靶蛋白相互作用的目的蛋白,也会被一同捕获及纯化得到,通过SDS-PAGE、Western和质谱等方法鉴定与靶蛋白结合的蛋白。
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染色质免疫沉淀(ChIP)用于鉴定基因组中与靶蛋白(如转录因子和组蛋白)结合的区域。将蛋白质与DNA暂时交联固定并剪切DNA,目标蛋白与核酸序列一起被沉淀后通过高通量测序、Southern和PCR等方法进行DNA鉴定。确定与靶蛋白结合的DNA片段。
RNA免疫沉淀(RIP)原理与ChIP相似,与靶蛋白结合的RNA被沉淀后,用高通量测序、RT-PCR或Northern等方法对沉淀进行RNA鉴定。
随着技术的发展,目前磁性微粒已经取代琼脂糖成为免疫沉淀的首选方法,由于磁性微粒明显小于琼脂糖,因此可以与更多的抗体结合,纯化是可以使用磁力架进行,避免了离心分离可能导致的抗原-抗体结合的破坏,避免了检测目的的损失。
上述各种免疫沉淀的异同总结如下:
实验项目 | 基本原理 | 检测目标 | 检测方法 |
免疫沉淀(IP) | 抗原-抗体特异性结合 | 靶蛋白 | Western、质谱 |
免疫共沉淀(Co-IP) | 抗原-抗体特异性结合 | 与靶蛋白结合的蛋白 | Western、质谱 |
染色质免疫沉淀(ChIP) | 抗原-抗体特异性结合 | 与靶蛋白结合的DNA | 测序、PCR或Southern |
RNA免疫沉淀 | 抗原-抗体特异性结合 | 与靶蛋白结合的RNA | 测序、RT-PCR或Northern |
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